Tham khảo Công_nghệ_nano_DNA

  1. 1 2 DNA polyhedra: Goodman, Russel P.; Schaap, Iwan A. T.; Tardin, C. F.; Erben, Christof M.; Berry, Richard M.; Schmidt, C.F.; Turberfield, Andrew J. (ngày 9 tháng 12 năm 2005). “Rapid chiral assembly of rigid DNA building blocks for molecular nanofabrication”. Science 310 (5754): 1661–1665. Bibcode:2005Sci...310.1661G. PMID 16339440. doi:10.1126/science.1120367
  2. 1 2 Overview: Mao, Chengde (tháng 12 năm 2004). “The emergence of complexity: lessons from DNA”. PLoS Biology 2 (12): 2036–2038. PMC 535573. PMID 15597116. doi:10.1371/journal.pbio.0020431
  3. 1 2 3 4 5 Overview: Seeman, Nadrian C. (tháng 6 năm 2004). “Nanotechnology and the double helix”. Scientific American 290 (6): 64–75. PMID 15195395. doi:10.1038/scientificamerican0604-64
  4. Background: Pelesko, John A. (2007). Self-assembly: the science of things that put themselves together. New York: Chapman & Hall/CRC. tr. 5, 7. ISBN 978-1-58488-687-7
  5. 1 2 3 4 5 6 Overview: doi:10.1146/annurev-biochem-060308-102244
    Hoàn thành chú thích này
  6. Background: Long, Eric C. (1996). “Fundamentals of nucleic acids”. Trong Hecht, Sidney M. Bioorganic chemistry: nucleic acids. New York: Oxford University Press. tr. 4–10. ISBN 0-19-508467-5
  7. RNA nanotechnology: Chworos, Arkadiusz; Severcan, Isil; Koyfman, Alexey Y.; Weinkam, Patrick; Oroudjev, Emin; Hansma, Helen G.; Jaeger, Luc (2004). “Building Programmable Jigsaw Puzzles with RNA”. Science 306 (5704): 2068–2072. Bibcode:2004Sci...306.2068C. PMID 15604402. doi:10.1126/science.1104686
  8. RNA nanotechnology: Guo, Peixuan (2010). “The Emerging Field of RNA Nanotechnology”. Nature Nanotechnology 5 (12): 833–842. Bibcode:2010NatNa...5..833G. PMC 3149862. PMID 21102465. doi:10.1038/nnano.2010.231
  9. 1 2 3 4 Dynamic DNA nanotechnology: doi:10.1038/nchem.957
    Hoàn thành chú thích này
  10. 1 2 3 4 Structural DNA nanotechnology: Seeman, Nadrian C. (tháng 11 năm 2007). “An overview of structural DNA nanotechnology”. Molecular Biotechnology 37 (3): 246–257. PMC 3479651. PMID 17952671. doi:10.1007/s12033-007-0059-4
  11. Dynamic DNA nanotechnology: doi:10.1016/j.copbio.2006.10.004
    Hoàn thành chú thích này
  12. Other arrays: Strong, Michael (tháng 3 năm 2004). “Protein Nanomachines”. PLoS Biology 2 (3): e73. PMC 368168. PMID 15024422. doi:10.1371/journal.pbio.0020073
  13. doi:10.1126/science.1089389
    Hoàn thành chú thích này
  14. DX arrays: Winfree, Erik; Liu, Furong; Wenzler, Lisa A.; Seeman, Nadrian C. (ngày 6 tháng 8 năm 1998). “Design and self-assembly of two-dimensional DNA crystals”. Nature 394 (6693): 529–544. Bibcode:1998Natur.394..539W. PMID 9707114. doi:10.1038/28998
  15. DX arrays: Liu, Furong; Sha, Ruojie; Seeman, Nadrian C. (ngày 10 tháng 2 năm 1999). “Modifying the surface features of two-dimensional DNA crystals”. Journal of the American Chemical Society 121 (5): 917–922. doi:10.1021/ja982824a
  16. Other arrays: Mao, Chengde; Sun, Weiqiong; Seeman, Nadrian C. (ngày 16 tháng 6 năm 1999). “Designed two-dimensional DNA Holliday junction arrays visualized by atomic force microscopy”. Journal of the American Chemical Society 121 (23): 5437–5443. doi:10.1021/ja9900398
  17. Other arrays: Constantinou, Pamela E.; Wang, Tong; Kopatsch, Jens; Israel, Lisa B.; Zhang, Xiaoping; Ding, Baoquan; Sherman, William B.; Wang, Xing; Zheng, Jianping; Sha, Ruojie; Seeman, Nadrian C. (ngày 21 tháng 9 năm 2006). “Double cohesion in structural DNA nanotechnology”. Organic and Biomolecular Chemistry 4 (18): 3414–3419. PMC 3491902. PMID 17036134. doi:10.1039/b605212f
  18. Other arrays: Mathieu, Frederick; Liao, Shiping; Kopatsch, Jens; Wang, Tong; Mao, Chengde; Seeman, Nadrian C. (tháng 4 năm 2005). “Six-helix bundles designed from DNA”. Nano Letters 5 (4): 661–665. Bibcode:2005NanoL...5..661M. PMC 3464188. PMID 15826105. doi:10.1021/nl050084f
  19. 1 2 3 History: Seeman, Nadrian (ngày 9 tháng 6 năm 2010). “Structural DNA nanotechnology: growing along with Nano Letters”. Nano Letters 10 (6): 1971–1978. Bibcode:2010NanoL..10.1971S. PMC 2901229. PMID 20486672. doi:10.1021/nl101262u
  20. Algorithmic self-assembly: Rothemund, Paul W. K.; Papadakis, Nick; Winfree, Erik (tháng 12 năm 2004). “Algorithmic self-assembly of DNA Sierpinski triangles”. PLoS Biology 2 (12): 2041–2053. PMC 534809. PMID 15583715. doi:10.1371/journal.pbio.0020424
  21. Algorithmic self-assembly: Barish, Robert D.; Rothemund, Paul W. K.; Winfree, Erik (tháng 12 năm 2005). “Two computational primitives for algorithmic self-assembly: copying and counting”. Nano Letters 5 (12): 2586–2592. Bibcode:2005NanoL...5.2586B. PMID 16351220. doi:10.1021/nl052038l
  22. 1 2 3 4 Design: doi:10.1002/anie.200502358
    Hoàn thành chú thích này
  23. DNA nanotubes: Rothemund, Paul W. K.; Ekani-Nkodo, Axel; Papadakis, Nick; Kumar, Ashish; Fygenson, Deborah Kuchnir & Winfree, Erik (ngày 22 tháng 12 năm 2004). “Design and Characterization of Programmable DNA Nanotubes”. Journal of the American Chemical Society 126 (50): 16344–16352. PMID 15600335. doi:10.1021/ja044319l
  24. DNA nanotubes: Yin, P.; Hariadi, R. F.; Sahu, S.; Choi, H. M. T.; Park, S. H.; Labean, T. H.; Reif, J. H. (ngày 8 tháng 8 năm 2008). “Programming DNA Tube Circumferences”. Science 321 (5890): 824–826. Bibcode:2008Sci...321..824Y. PMID 18687961. doi:10.1126/science.1157312
  25. Three-dimensional arrays: Zheng, Jianping; Birktoft, Jens J.; Chen, Yi; Wang, Tong; Sha, Ruojie; Constantinou, Pamela E.; Ginell, Stephan L.; Mao, Chengde; Seeman, Nadrian C. (ngày 3 tháng 9 năm 2009). “From molecular to macroscopic via the rational design of a self-assembled 3D DNA crystal”. Nature 461 (7260): 74–77. Bibcode:2009Natur.461...74Z. PMC 2764300. PMID 19727196. doi:10.1038/nature08274
  26. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Overview: doi:10.1038/nnano.2011.187
    Hoàn thành chú thích này
  27. DNA polyhedra: Zhang, Yuwen; Seeman, Nadrian C. (ngày 1 tháng 3 năm 1994). “Construction of a DNA-truncated octahedron”. Journal of the American Chemical Society 116 (5): 1661–1669. doi:10.1021/ja00084a006
  28. DNA polyhedra: Shih, William M.; Quispe, Joel D.; Joyce, Gerald F. (ngày 12 tháng 2 năm 2004). “A 1.7-kilobase single-stranded DNA that folds into a nanoscale octahedron”. Nature 427 (6975): 618–621. Bibcode:2004Natur.427..618S. PMID 14961116. doi:10.1038/nature02307
  29. 1 2 3 DNA origami: Rothemund, Paul W. K. (ngày 16 tháng 3 năm 2006). “Folding DNA to create nanoscale shapes and patterns”. Nature 440 (7082): 297–302. Bibcode:2006Natur.440..297R. PMID 16541064. doi:10.1038/nature04586
  30. 1 2 DNA origami: Douglas, Shawn M.; Dietz, Hendrik; Liedl, Tim; Högberg, Björn; Graf, Franziska; Shih, William M. (ngày 21 tháng 5 năm 2009). “Self-assembly of DNA into nanoscale three-dimensional shapes”. Nature 459 (7245): 414–418. Bibcode:2009Natur.459..414D. PMC 2688462. PMID 19458720. doi:10.1038/nature08016
  31. 1 2 DNA boxes: Andersen, Ebbe S.; Dong, Mingdong; Nielsen, Morten M.; Jahn, Kasper; Subramani, Ramesh; Mamdouh, Wael; Golas, Monika M.; Sander, Bjoern và đồng nghiệp (ngày 7 tháng 5 năm 2009). “Self-assembly of a nanoscale DNA box with a controllable lid”. Nature 459 (7243): 73–76. Bibcode:2009Natur.459...73A. PMID 19424153. doi:10.1038/nature07971
  32. DNA boxes: Ke, Yonggang; Sharma, Jaswinder; Liu, Minghui; Jahn, Kasper; Liu, Yan; Yan, Hao (ngày 10 tháng 6 năm 2009). “Scaffolded DNA origami of a DNA tetrahedron molecular container”. Nano Letters 9 (6): 2445–2447. Bibcode:2009NanoL...9.2445K. PMID 19419184. doi:10.1021/nl901165f
  33. 1 2 Overview: doi:10.1002/cbic.200900286
    Hoàn thành chú thích này
  34. Nanoarchitecture: Zheng, Jiwen; Constantinou, Pamela E.; Micheel, Christine; Alivisatos, A. Paul; Kiehl, Richard A.; Seeman Nadrian C. (tháng 7 năm 2006). “2D Nanoparticle Arrays Show the Organizational Power of Robust DNA Motifs”. Nano Letters 6 (7): 1502–1504. Bibcode:2006NanoL...6.1502Z. PMC 3465979. PMID 16834438. doi:10.1021/nl060994c
  35. Nanoarchitecture: Park, Sung Ha; Pistol, Constantin; Ahn, Sang Jung; Reif, John H.; Lebeck, Alvin R.; Dwyer, Chris; LaBean, Thomas H. (tháng 10 năm 2006). “Finite-size, fully addressable DNA tile lattices formed by hierarchical assembly procedures”. Angewandte Chemie 118 (40): 749–753. doi:10.1002/ange.200690141
  36. Nanoarchitecture: Cohen, Justin D.; Sadowski, John P.; Dervan, Peter B. (ngày 22 tháng 10 năm 2007). “Addressing single molecules on DNA nanostructures”. Angewandte Chemie International Edition 46 (42): 7956–7959. PMID 17763481. doi:10.1002/anie.200702767
  37. Nanoarchitecture: Maune, Hareem T.; Han, Si-Ping; Barish, Robert D.; Bockrath, Marc; Goddard III, William A.; Rothemund, Paul W. K.; Winfree, Erik (tháng 1 năm 2009). “Self-assembly of carbon nanotubes into two-dimensional geometries using DNA origami templates”. Nature Nanotechnology 5 (1): 61–66. Bibcode:2010NatNa...5...61M. PMID 19898497. doi:10.1038/nnano.2009.311
  38. Nanoarchitecture: doi:10.1021/nn1035075
    Hoàn thành chú thích này
  39. Nanoarchitecture: doi:10.1002/anie.200460257
    Hoàn thành chú thích này
  40. 1 2 3 4 DNA machines: Bath, Jonathan; Turberfield, Andrew J. (tháng 5 năm 2007). “DNA nanomachines”. Nature Nanotechnology 2 (5): 275–284. Bibcode:2007NatNa...2..275B. PMID 18654284. doi:10.1038/nnano.2007.104
  41. DNA machines: Mao, Chengde; Sun, Weiqiong; Shen, Zhiyong; Seeman, Nadrian C. (ngày 14 tháng 1 năm 1999). “A DNA nanomechanical device based on the B-Z transition”. Nature 397 (6715): 144–146. Bibcode:1999Natur.397..144M. PMID 9923675. doi:10.1038/16437
  42. DNA machines: Yurke, Bernard; Turberfield, Andrew J.; Mills, Allen P., Jr; Simmel, Friedrich C.; Neumann, Jennifer L. (ngày 10 tháng 8 năm 2000). “A DNA-fuelled molecular machine made of DNA”. Nature 406 (6796): 605–609. Bibcode:2000Natur.406..605Y. PMID 10949296. doi:10.1038/35020524
  43. DNA machines: Yan, Hao; Zhang, Xiaoping; Shen, Zhiyong; Seeman, Nadrian C. (ngày 3 tháng 1 năm 2002). “A robust DNA mechanical device controlled by hybridization topology”. Nature 415 (6867): 62–65. Bibcode:2002Natur.415...62Y. PMID 11780115. doi:10.1038/415062a
  44. DNA machines: doi:10.1002/ange.200351818
    Hoàn thành chú thích này
  45. DNA machines: doi:10.1038/nnano.2008.3
    Hoàn thành chú thích này
  46. Applications: doi:10.1126/science.1214081
    Hoàn thành chú thích này
  47. DNA walkers: Shin, Jong-Shik; Pierce, Niles A. (ngày 8 tháng 9 năm 2004). “A synthetic DNA walker for molecular transport”. Journal of the American Chemical Society 126 (35): 10834–10835. PMID 15339155. doi:10.1021/ja047543j
  48. DNA walkers: Sherman, William B.; Seeman, Nadrian C. (tháng 7 năm 2004). “A precisely controlled DNA biped walking device”. Nano Letters 4 (7): 1203–1207. Bibcode:2004NanoL...4.1203S. doi:10.1021/nl049527q
  49. DNA walkers: Tian, Ye; He, Yu; Chen, Yi; Yin, Peng; Mao, Chengde (ngày 11 tháng 7 năm 2005). “A DNAzyme that walks processively and autonomously along a one-dimensional track”. Angewandte Chemie 117 (28): 4429–4432. doi:10.1002/ange.200500703
  50. DNA walkers: Bath, Jonathan; Green, Simon J.; Turberfield, Andrew J. (ngày 11 tháng 7 năm 2005). “A free-running DNA motor powered by a nicking enzyme”. Angewandte Chemie International Edition 44 (28): 4358–4361. doi:10.1002/anie.200501262
  51. Functional DNA walkers: Lund, Kyle; Manzo, Anthony J.; Dabby, Nadine; Michelotti, Nicole; Johnson-Buck, Alexander; Nangreave, Jeanette; Taylor, Steven; Pei, Renjun; Stojanovic, Milan N.; Walter, Nils G.; Winfree, Erik; Yan, Hao (ngày 13 tháng 5 năm 2010). “Molecular robots guided by prescriptive landscapes”. Nature 465 (7295): 206–210. Bibcode:2010Natur.465..206L. PMC 2907518. PMID 20463735. doi:10.1038/nature09012
  52. Functional DNA walkers: He, Yu; Liu, David R. (tháng 11 năm 2010). “Autonomous multistep organic synthesis in a single isothermal solution mediated by a DNA walker”. Nature Nanotechnology 5 (11): 778–782. Bibcode:2010NatNa...5..778H. PMC 2974042. PMID 20935654. doi:10.1038/nnano.2010.190
  53. 1 2 3 Kinetic assembly: Yin, Peng; Choi, Harry M. T.; Calvert, Colby R.; Pierce, Niles A. (ngày 17 tháng 1 năm 2008). “Programming biomolecular self-assembly pathways”. Nature 451 (7176): 318–322. Bibcode:2008Natur.451..318Y. PMID 18202654. doi:10.1038/nature06451
  54. Fuzzy and Boolean logic gates based on DNA: doi:10.1002/smll.201402755
    Hoàn thành chú thích này
  55. Strand displacement cascades: doi:10.1126/science.1132493
    Hoàn thành chú thích này
  56. Strand displacement cascades: doi:10.1126/science.1200520
    Hoàn thành chú thích này
  57. 1 2 3 4 5 History/applications: Service, Robert F. (ngày 3 tháng 6 năm 2011). “DNA nanotechnology grows up”. Science 332 (6034): 1140–1143. doi:10.1126/science.332.6034.1140
  58. M. Zadegan, Reza; et, al. (2012). “Construction of a 4 Zeptoliters Switchable 3D DNA Box Origami”. ACS Nano 6 (11): 10050–10053. doi:10.1021/nn303767b
  59. Applications: Jungmann, Ralf; Renner, Stephan; Simmel, Friedrich C. (tháng 3 năm 2008). “From DNA nanotechnology to synthetic biology”. HFSP journal 2 (2): 99–109. PMC 2645571. PMID 19404476. doi:10.2976/1.2896331
  60. Lovy, Howard (ngày 5 tháng 7 năm 2011). “DNA cages can unleash meds inside cells”. fiercedrugdelivery.com. Truy cập ngày 22 tháng 9 năm 2013. 
  61. Walsh, Anthony; Yin, Hai; Erben, Christoph; Wood, Matthew; Turberfield, Andrew (2011). “DNA Cage Delivery to Mammalian Cells”. ACS Nano (ACS Publications) 5 (7): 5427–5432. PMID 21696187. doi:10.1021/nn2005574
  62. Trafton, Anne (ngày 4 tháng 6 năm 2012). “Researchers achieve RNA interference, in a lighter package”. MIT News. Truy cập ngày 22 tháng 9 năm 2013. 
  63. Lee, Hyukjin; Lytton-Jean, Abigail; Chen, Yi; Love, Kevin; Park, Angela; Karagiannis, Emmanouil; Sehgal, Alfica; Querbes, William và đồng nghiệp (2012). “Molecularly self-assembled nucleic acid nanoparticles for targeted in vivo siRNA delivery” (PDF). Nature Nanotechnology (Nature) 7 (6): 389–393. doi:10.1038/NNANO.2012.73Pdf
  64. 1 2 3 Design: Brenneman, Arwen; Condon, Anne (ngày 25 tháng 9 năm 2002). “Strand design for biomolecular computation”. Theoretical Computer Science 287: 39–58. doi:10.1016/S0304-3975(02)00135-4
  65. Overview: Lin, Chenxiang; Liu, Yan; Rinker, Sherri; Yan, Hao (ngày 11 tháng 8 năm 2006). “DNA tile based self-assembly: building complex nanoarchitectures”. ChemPhysChem 7 (8): 1641–1647. PMID 16832805. doi:10.1002/cphc.200600260
  66. 1 2 3 Design: Dirks, Robert M.; Lin, Milo; Winfree, Erik; Pierce, Niles A. (ngày 15 tháng 2 năm 2004). “Paradigms for computational nucleic acid design”. Nucleic Acids Research 32 (4): 1392–1403. PMC 390280. PMID 14990744. doi:10.1093/nar/gkh291
  67. Methods: doi:10.1002/0471142727.mb0211s42
    Hoàn thành chú thích này
  68. Methods: doi:10.1002/0471142727.mb0212s42
    Hoàn thành chú thích này
  69. Methods: doi:10.1002/9780470089941.et0202s5
    Hoàn thành chú thích này
  70. Methods: doi:10.1002/0471142727.mb0207s47
    Hoàn thành chú thích này
  71. Methods: doi:10.1002/0471142700.nc1110s11
    Hoàn thành chú thích này
  72. Methods: doi:10.1007/978-1-61779-142-0_1
    Hoàn thành chú thích này
  73. Methods: Bloomfield, Victor A.; Crothers, Donald M.; Tinoco, Jr., Ignacio (2000). Nucleic acids: structures, properties, and functions. Sausalito, Calif: University Science Books. tr. 84–86, 396–407. ISBN 0-935702-49-0
  74. 1 2 3 History: Pelesko, John A. (2007). Self-assembly: the science of things that put themselves together. New York: Chapman & Hall/CRC. tr. 201, 242, 259. ISBN 978-1-58488-687-7
  75. History: See “Current crystallization protocol”. Nadrian Seeman Lab. 
  76. 1 2 DNA origami: Rothemund, Paul W. K. (2006). “Scaffolded DNA origami: from generalized multicrossovers to polygonal networks”. Trong Chen, Junghuei; Jonoska, Natasha; Rozenberg, Grzegorz. Nanotechnology: science and computation. Natural Computing Series. New York: Springer. tr. 3–21. ISBN 978-3-540-30295-7. doi:10.1007/3-540-30296-4_1
  77. Nanoarchitecture: Robinson, Bruche H.; Seeman, Nadrian C. (tháng 8 năm 1987). “The design of a biochip: a self-assembling molecular-scale memory device”. Protein Engineering 1 (4): 295–300. PMID 3508280. doi:10.1093/protein/1.4.295
  78. History: Hopkin, Karen (tháng 8 năm 2011). “Profile: 3-D seer”. The Scientist. Truy cập ngày 8 tháng 8 năm 2011. 

Tài liệu tham khảo

WikiPedia: Công_nghệ_nano_DNA http://www.britannica.com/EBchecked/topic/962484 http://www.fiercedrugdelivery.com/story/dna-cages-... http://www.mdpi.com/1422-0067/13/6/7149 http://www.nature.com/nnano/journal/v7/n6/pdf/nnan... http://www.scientificamerican.com/article/nanotech... http://www.the-scientist.com/?articles.view/articl... http://adsabs.harvard.edu/abs/1998Natur.394..539W http://adsabs.harvard.edu/abs/1999Natur.397..144M http://adsabs.harvard.edu/abs/2000Natur.406..605Y http://adsabs.harvard.edu/abs/2002Natur.415...62Y